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Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

278

NOMBRE DE NOTICES

103

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

88 %

MOTS CLES

Experimental evolution Acid mine drainage AMD Horizontal gene transfer Activated sludge Anaerobic Secondary metabolites Brochothrix thermosphacta Aphids Heavy metal resistance Bactérie entomopathogène Bacteriocin Xenorhabdus DDDH Microbiology Functional genomics Magnetotactic bacteria Mobile genetic elements Crystallography Genome evolution Arsenic Genome Antibiotic resistance Nitrogen fixation Betaproteobacteria Metabolomics Continuous culture Directed evolution Flavobacterium psychrophilum Comparative genomic analysis Dichloromethane Acyl homoserine lactone Dehalogenation Virulence Bioassays Rhizobium Virulence factors Phylogeny Bacterium Escherichia coli Bioremediation Rhizobia Food Digital DNA-DNA hybridization Acidithiobacillus ferrooxidans Bacterial genetics Transcriptome Acid stress Symbiosis Genome sequence ACL Metabolism Cyanobacteria Lactic acid bacteria Diversity Clostridium difficile Bacteria Transcriptomics Pangenome Adaptation Average nucleotide identity CTX-M-15 Fish pathogen Comparative genomics Bacterial Ralstonia solanacearum DNA Bactérie Insect FAMILY Vibrio tapetis Thermococcus Oxidative stress Chloromethane Entomopathogenic bacteria Metagenomics Gut microbiota Polyphasic taxonomy Coevolution Genomes Biodiversity Bacteroidetes Clostridioides difficile Acinetobacter baumannii Pseudomonas aeruginosa Biofilm Mineral weathering Aquaculture Complete genome ESBL Bacteriophage Genomics Proteomics Plasmid Archaea Alkaline thermal spring Agrobacterium tumefaciens Thermophile Pathogenicity Actinorhizal symbiosis Evolution